Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx5Q9JL61 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx5Q9JL61 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms