Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AatfQ9JKX4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms