Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp4Q9JKV5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scamp4Q9JKV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms