Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ldb3Q9JKS4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ldb3Q9JKS4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ldb3Q9JKS4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.2 ms