Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nova1Q9JKN6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nova1Q9JKN6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nova1Q9JKN6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms