Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnga3Q9JJZ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms