Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2aQ9JJN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Oxct2aQ9JJN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oxct2aQ9JJN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms