Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN0

Polh, DNA polymerase eta, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolhQ9JJN0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolhQ9JJN0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolhQ9JJN0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolhQ9JJN0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms