Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pus3Q9JI38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pus3Q9JI38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms