Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dkc1Q9ESX5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dkc1Q9ESX5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms