Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc17Q9ESX4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zcchc17Q9ESX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc17Q9ESX4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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