Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pgpep1Q9ESW8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pgpep1Q9ESW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pgpep1Q9ESW8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pgpep1Q9ESW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pgpep1Q9ESW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pgpep1Q9ESW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pgpep1Q9ESW8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgpep1Q9ESW8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgpep1Q9ESW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgpep1Q9ESW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgpep1Q9ESW8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgpep1Q9ESW8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pgpep1Q9ESW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms