Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn10Q9ESK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn10Q9ESK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn10Q9ESK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn10Q9ESK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms