Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DysfQ9ESD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DysfQ9ESD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DysfQ9ESD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms