Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C1qtnf3Q9ES30 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1qtnf3Q9ES30 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf3Q9ES30 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms