Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sertad3Q9ERC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sertad3Q9ERC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms