Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Dap3Q9ER88 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dap3Q9ER88 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms