Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr6Q9EQ16 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cxcr6Q9EQ16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cxcr6Q9EQ16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcr6Q9EQ16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcr6Q9EQ16 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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