Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cpsf1Q9EPU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cpsf1Q9EPU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms