Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SyncQ9EPM5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SyncQ9EPM5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SyncQ9EPM5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms