Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp1bQ9EPL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp1bQ9EPL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp1bQ9EPL6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms