Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa8Q9DCJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa8Q9DCJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms