Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syde1Q9DBZ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde1Q9DBZ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms