Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tm9sf1Q9DBU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf1Q9DBU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf1Q9DBU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms