Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
March8Q9DBD2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
March8Q9DBD2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms