Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Erv3Q9DAX3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Erv3Q9DAX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Erv3Q9DAX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Erv3Q9DAX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms