Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim23Q9DAL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim23Q9DAL0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim23Q9DAL0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms