Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdzd9Q9D9M4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
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