Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms