Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms