Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms