Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl3Q9D8K3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl3Q9D8K3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms