Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnajc4Q9D844 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajc4Q9D844 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc4Q9D844 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms