Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnfsf13Q9D777 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13Q9D777 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms