Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sdr42e1Q9D665 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr42e1Q9D665 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms