Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn11Q9D572 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn11Q9D572 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms