Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sohlh2Q9D489 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sohlh2Q9D489 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sohlh2Q9D489 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms