Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D454 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D454 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D454 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D454 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D454 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D454 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D454 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D454 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D454 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D454 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q9D454 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D454 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D454 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D454 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D454 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9D454 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D454 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9D454 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D454 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D454 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D454 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D454 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D454 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms