Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl53Q9D1H8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl53Q9D1H8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms