Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hddc3Q9D114 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hddc3Q9D114 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc3Q9D114 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms