Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms