Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pbdc1Q9D0B6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pbdc1Q9D0B6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms