Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mms19Q9D071 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mms19Q9D071 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms