Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prelid3bQ9CYY7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms