Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW2

Mrps22, 28S ribosomal protein S22, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps22Q9CXW2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mrps22Q9CXW2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrps22Q9CXW2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrps22Q9CXW2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms