Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BccipQ9CWI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BccipQ9CWI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms