Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.7 ms