Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cox16Q9CR63 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cox16Q9CR63 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox16Q9CR63 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms