Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl28Q9CR40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms