Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4931417E11RikQ9CR05 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4931417E11RikQ9CR05 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931417E11RikQ9CR05 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms